基因组服务 —— 生物信息学
转录组生物信息学服务:利用高通量测序平台对人类个体或群体的RNA进行测序,并进行生物信息学相关分析,全面剖析转录层面发生的改变,从RNA水平剖析疾病致病机制。主要包括:全转录组测序分析、 lncRNA测序分析、 small RNA测序分析。

转录组


  • 样本要求
  • 检测原理
  • 分析流程
  • 分析内容

组织样本

1)新鲜组织在-70℃下保存冰冻组织。

2)总量最好在20-30mg以上。


全转录组RNA或lncRNA测序样品

1)类型:去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。

2)需求量:人、大鼠、小鼠样品Total RNA≥2 μg; DSN全转录组方法建库Total RNA≥ 2 ug。

3)浓度:去除rRNA方法建库 ≥200 ng/μl; DSN全转录组方法建库 ≥400 ng/ul。

4)纯度: OD260/280=1.8~2.2, OD260/230=1.8~2.2, 动物样本RIN≥7.0, 28S:18S≥1.0


Small RNA测序样品

1)类型:去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA。

2)需求量: ≥10 μg。

3)浓度: ≥200 ng/μl。

4)纯度: OD260/280=1.8~2.2, OD260/230=1.8~2.2,28S:18S≥1.5, RIN≥8.0。